Lancé sur les traces d'une arme mythique qui permettrait de les vaincre, il doit faire ses preuves comme pirate avant de pouvoir disposer de son propre navire. 

Le jeu permet de recruter plusieurs compagnons d'équipage et d'explorer plusieurs îles.

Risen 2 prend place après que les Titans aient dévasté le monde en détruisant quasi totalement l'humanité, une nouvelle menace surgit alors du plus profond des océans. Des créatures monstrueuses attaques en effet toutes formes de navigation, empêchant les habitants d'utiliser leurs bateaux.