Dans Yakuza 6, Kazuma Kiryu découvrira jusqu'à où certains sont prêts à aller pour leur famille, que les liens soient de sang ou d'alliance, tout en enquêtant sur une série d'événements mystérieux mettant en jeu ses proches. C'est un Kiryu plus vieux, tout juste libéré de prison après 3 ans, qui se met à la recherche de sa fille d'adoption, Haruka, portée disparue dans l'orphelinat dont il s'occupe.